玛纳斯县博物馆主体建筑面积4840平方米，其中展厅面积2100平方米，共三层。基本陈列分为《玛河魂展厅》《玛纳斯县家风家训馆》《玛纳斯历史文物陈列展》《玛纳斯国防教育展》《清风馆》四大块。馆藏文物2100件，其中二级文物3件，三级文物7件，一般文物1784件。

玛纳斯县博物馆承担着为全县各界群众普及科学和历史知识，弘扬祖国优秀文化传统及促进全县对外文化交流的任务，特别是近年来作为县青少年爱国主义和历史文化教育基地，在切实加强基地建设与管理，加强未成年人教育方面，都发挥了积极作用，每年免费开放天数达到300天以上。2021年被昌吉州宣传部公布为州级爱国主义教育基地，2020年被中国博物馆协会评为国家三级博物馆，是我县重要的公共文化窗口单位。